全身吸收作用与组织器官的敏感性相关，吸收作用主要由于其脂溶性扩散被动性吸收所致。芥子气的主要代谢产物及排泄途径包括，与体内多种生物大分子反应，如蛋白质、氨基酸等形成烃化产物。
大部分与谷胱甘肽或半胱氨酸结合生成无毒的代谢产物排出体外，经水解或氧化生成二羟二乙硫醚、芥子砜或芥子亚砜。转变为羟乙磺酸、羟基乙酸及无机硫酸盐等。代谢产物大部分经尿液排出。
芥子气的毒性通常认为是其对DNA的烃化作用引起。作为一种双烃化剂，它能与DNA中强亲核性的富电子的原子反应，使得DNA对它的作用高度敏感。
研究表明，芥子气烃化反应的主要功能基团是赖氨酸的氨基、谷氨酸的羧基以及谷光甘肽和半胱氨酸的巯基，使DNA形成交联，抑制DNA的复制和精确修复能力。烃化后的蛋白质发生变性、补体失活及免疫功能下降等。芥子气对己糖激酶、胃蛋白酶、胆碱酯酶和某些脱氢酶和氧化酶等至少30多种酶有抑制作用。己糖激酶的抑制可影响糖的酵解和转化，导致……
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